La ville de Cernavodă est située sur le Plateau de Dobrogea de Sud, a la confluence du fleuve Danube avec le Canal Danube – Mer Noire, respectivement les vallées Carasu, Țibrin et Siliștea. L’élément définitoire de la ville et son territoire administratif est le Canal Danube – Mer Noire, comme axe de structuration urbanistique de la localité, qu’elle divise en deux zones distinctes.